SHMT1 (серин хидроксиметилтрансфераза) C1420T полиморфизъм

Генетичен вариант в ензим от фолатния цикъл, чието клинично значение не е установено

Какво представлява?

SHMT1 е генът, който носи инструкциите за цитозолната серин хидроксиметилтрансфераза – ензим от фолатния цикъл. Той извършва обратима реакция: превръща аминокиселината серин и тетрахидрофолата в глицин и 5,10-метилентетрахидрофолат, тоест доставя „въглеродните тухлички“, от които клетката прави ДНК градивни единици, а по друг път – и метилови групи. Тази стъпка стои „нагоре по веригата“ спрямо MTHFR: MTHFR получава именно 5,10-метилентетрахидрофолата и го превръща в активната форма на фолата, използвана при обезвреждането на хомоцистеина. В така наречените „метилационни профили“ се изследва един конкретен вариант на този ген – C1420T (rs1979277), при който в позиция 1420 от кодиращата последователност вместо C стои T, а в белтъка на това място вместо левцин застава фенилаланин (означава се и като L474F). Тъй като от всеки родител се наследява по едно копие, възможните резултати са три: 1420CC, 1420CT и 1420TT. Важното още в началото: това е генетичен тест, а не измерване на фолат или на активността на ензима, и резултатът остава непроменен през целия живот.

Референтни стойности

Това е генотипиране, а не измерване, затова тук няма числови референтни граници и няма „висока“ или „ниска“ стойност – има само три възможни резултата. Нито един от тях не е „абнормен“ в обичайния смисъл: и трите генотипа се срещат сред здрави хора. По данни на dbSNP (NCBI) честотата на 1420T алела е около 0.30 при хора от европейски произход, около 0.34 при африкански и едва 0.07–0.08 при източноазиатски произход – тоест малко над половината европейци носят поне едно T копие. Бланките изглеждат различно: някои изписват направо генотипа (CC, CT, TT), други пишат „хомозиготен“ или „хетерозиготен“, трети добавят техническото означение – „C1420T“, „1420C>T“, „L474F“ или „rs1979277“. Резултатът не се влияе от храненето, от приема на добавки, от бременност или от възпаление и не се повтаря – веднъж определен, остава валиден за цял живот. Как точно е формулиран изводът, сверявайте с бланката на Вашата лаборатория.

Кога и към кого да се обърна?

Повечето хора получават този резултат, без да са го търсили целенасочено – SHMT1 върви в готовите пакети „метилационен профил“, които у нас се предлагат при повтарящи се спонтанни аборти, преди ин витро процедура, при повишен хомоцистеин или просто като част от „профилактичен генетичен панел“, обикновено заедно с MTHFR, MTR, MTRR, CBS и AHCY. Затова е полезно да се знае предварително, че SHMT1 е сред най-слабо обоснованите елементи от такъв пакет и че резултатът му на практика не променя лечението. Тълкуването е работа на клиничен генетик, а не на самата бланка – и първият въпрос, който той обикновено задава, е защо изследването изобщо е било направено. Ако поводът е реален (умора, анемия, повишен хомоцистеин, репродуктивни затруднения), посоката е към показателите, които се измерват и лекуват: фолат, витамин B12 и хомоцистеин, а при отклонение – и към причините за тях (хранене, всмукване в червата, бъбречна функция, лекарства). Не започвайте и не спирайте добавки заради този генотип. Ако вече Ви е назначен висок прием на фолиева киселина или на метилфолат на основание на генетичен резултат, обсъдете с лекуващия лекар на какво стъпва решението – високите дози фолат могат да маскират дефицит на витамин B12, а това е реален, а не теоретичен риск. Един генетичен вариант, особено толкова чест и с толкова неясно значение, не е диагноза и не решава сам въпроса какво да се прави оттук нататък.

Свързани показатели